Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdv3Q4VAA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdv3Q4VAA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdv3Q4VAA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdv3Q4VAA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdv3Q4VAA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdv3Q4VAA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdv3Q4VAA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms