Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a5Q4LDG0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a5Q4LDG0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a5Q4LDG0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214 ms