Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx49Q4FZF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx49Q4FZF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx49Q4FZF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx49Q4FZF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx49Q4FZF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx49Q4FZF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx49Q4FZF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ddx49Q4FZF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms