Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnpc3Q3UZ01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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