Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim15Q3UTD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim15Q3UTD9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim15Q3UTD9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.8 ms