Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Mindy4Q3UQI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy4Q3UQI9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy4Q3UQI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms