Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc4Q3UP24 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrc4Q3UP24 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrc4Q3UP24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms