Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r12cQ3UMT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppp1r12cQ3UMT1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r12cQ3UMT1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms