Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zswim8Q3UHH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zswim8Q3UHH1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zswim8Q3UHH1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Zswim8Q3UHH1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zswim8Q3UHH1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms