Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6K5

Spata6, Spermatogenesis-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6Q3U6K5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata6Q3U6K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata6Q3U6K5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata6Q3U6K5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata6Q3U6K5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms