Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Otud5Q3U2S4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Otud5Q3U2S4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Otud5Q3U2S4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Otud5Q3U2S4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,6 ms