Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem88bQ3TYP4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem88bQ3TYP4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88bQ3TYP4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms