Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col24a1Q30D77 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col24a1Q30D77 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col24a1Q30D77 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col24a1Q30D77 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms