Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Specc1lQ2KN98 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Specc1lQ2KN98 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1lQ2KN98 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1lQ2KN98 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms