Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cers3Q1A3B0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cers3Q1A3B0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cers3Q1A3B0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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