Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prok1Q14A28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prok1Q14A28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms