Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox12Q04890 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sox12Q04890 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox12Q04890 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox12Q04890 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms