Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox10Q04888 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox10Q04888 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox10Q04888 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sox10Q04888 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms