Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nf1Q04690 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nf1Q04690 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms