Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nhlh1Q02576 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nhlh1Q02576 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nhlh1Q02576 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhlh1Q02576 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.1 ms