Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp4Q00724 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp4Q00724 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp4Q00724 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms