Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msx3P70354 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx3P70354 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx3P70354 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx3P70354 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx3P70354 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx3P70354 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx3P70354 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx3P70354 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx3P70354 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms