Protein–RNA interactions for Protein: P70324

Tbx3, T-box transcription factor TBX3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx3P70324 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbx3P70324 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbx3P70324 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx3P70324 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx3P70324 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx3P70324 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx3P70324 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms