Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Traf5P70191 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf5P70191 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf5P70191 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Traf5P70191 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf5P70191 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Traf5P70191 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf5P70191 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf5P70191 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf5P70191 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms