Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr3bP59470 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3bP59470 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3bP59470 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms