Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpaP58389 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpaP58389 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpaP58389 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpaP58389 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpaP58389 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpaP58389 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpaP58389 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpaP58389 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpaP58389 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms