Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dpf3P58269 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dpf3P58269 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dpf3P58269 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dpf3P58269 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms