Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtskP55097 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtskP55097 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtskP55097 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtskP55097 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtskP55097 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtskP55097 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtskP55097 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtskP55097 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtskP55097 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtskP55097 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtskP55097 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtskP55097 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtskP55097 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtskP55097 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtskP55097 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtskP55097 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtskP55097 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtskP55097 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtskP55097 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtskP55097 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtskP55097 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtskP55097 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtskP55097 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtskP55097 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtskP55097 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtskP55097 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtskP55097 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtskP55097 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtskP55097 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtskP55097 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtskP55097 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtskP55097 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtskP55097 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtskP55097 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtskP55097 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtskP55097 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtskP55097 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtskP55097 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtskP55097 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtskP55097 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtskP55097 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtskP55097 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtskP55097 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtskP55097 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtskP55097 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtskP55097 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtskP55097 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtskP55097 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtskP55097 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtskP55097 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtskP55097 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtskP55097 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtskP55097 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtskP55097 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtskP55097 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtskP55097 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtskP55097 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtskP55097 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtskP55097 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtskP55097 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtskP55097 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CtskP55097 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtskP55097 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtskP55097 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtskP55097 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms