Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrlP54846 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NrlP54846 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrlP54846 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NrlP54846 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NrlP54846 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NrlP54846 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NrlP54846 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NrlP54846 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NrlP54846 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NrlP54846 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NrlP54846 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NrlP54846 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NrlP54846 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NrlP54846 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NrlP54846 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NrlP54846 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NrlP54846 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NrlP54846 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NrlP54846 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NrlP54846 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NrlP54846 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NrlP54846 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NrlP54846 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NrlP54846 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NrlP54846 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NrlP54846 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NrlP54846 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrlP54846 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrlP54846 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrlP54846 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrlP54846 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrlP54846 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrlP54846 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrlP54846 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrlP54846 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrlP54846 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrlP54846 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrlP54846 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrlP54846 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrlP54846 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrlP54846 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrlP54846 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrlP54846 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrlP54846 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrlP54846 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NrlP54846 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrlP54846 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrlP54846 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrlP54846 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrlP54846 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrlP54846 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrlP54846 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrlP54846 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrlP54846 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrlP54846 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms