Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc4P54775 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc4P54775 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms