Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ephb4P54761 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb4P54761 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb4P54761 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms