Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DbtP53395 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DbtP53395 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DbtP53395 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DbtP53395 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DbtP53395 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbtP53395 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbtP53395 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbtP53395 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbtP53395 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DbtP53395 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DbtP53395 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DbtP53395 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DbtP53395 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DbtP53395 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbtP53395 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbtP53395 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbtP53395 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DbtP53395 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbtP53395 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbtP53395 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbtP53395 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DbtP53395 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DbtP53395 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DbtP53395 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbtP53395 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbtP53395 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DbtP53395 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DbtP53395 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DbtP53395 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DbtP53395 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbtP53395 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbtP53395 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbtP53395 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbtP53395 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DbtP53395 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DbtP53395 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DbtP53395 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DbtP53395 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DbtP53395 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DbtP53395 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms