Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XpcP51612 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XpcP51612 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XpcP51612 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XpcP51612 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XpcP51612 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XpcP51612 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XpcP51612 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XpcP51612 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
XpcP51612 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XpcP51612 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XpcP51612 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XpcP51612 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XpcP51612 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XpcP51612 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XpcP51612 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XpcP51612 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XpcP51612 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XpcP51612 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XpcP51612 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XpcP51612 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XpcP51612 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XpcP51612 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XpcP51612 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XpcP51612 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XpcP51612 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XpcP51612 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XpcP51612 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XpcP51612 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XpcP51612 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XpcP51612 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XpcP51612 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XpcP51612 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XpcP51612 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
XpcP51612 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XpcP51612 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XpcP51612 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XpcP51612 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XpcP51612 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XpcP51612 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XpcP51612 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XpcP51612 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XpcP51612 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XpcP51612 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XpcP51612 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XpcP51612 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XpcP51612 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XpcP51612 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XpcP51612 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XpcP51612 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XpcP51612 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XpcP51612 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XpcP51612 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XpcP51612 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XpcP51612 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XpcP51612 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XpcP51612 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XpcP51612 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XpcP51612 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XpcP51612 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XpcP51612 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XpcP51612 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XpcP51612 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XpcP51612 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XpcP51612 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XpcP51612 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XpcP51612 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XpcP51612 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XpcP51612 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XpcP51612 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XpcP51612 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XpcP51612 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XpcP51612 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XpcP51612 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XpcP51612 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XpcP51612 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XpcP51612 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XpcP51612 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XpcP51612 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XpcP51612 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms