Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LmnaP48678 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LmnaP48678 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LmnaP48678 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LmnaP48678 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LmnaP48678 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LmnaP48678 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LmnaP48678 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LmnaP48678 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LmnaP48678 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LmnaP48678 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms