Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx2P48379 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rfx2P48379 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms