Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CratP47934 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CratP47934 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CratP47934 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CratP47934 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CratP47934 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CratP47934 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CratP47934 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CratP47934 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CratP47934 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CratP47934 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CratP47934 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CratP47934 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CratP47934 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CratP47934 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CratP47934 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CratP47934 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CratP47934 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CratP47934 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CratP47934 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CratP47934 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CratP47934 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CratP47934 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CratP47934 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CratP47934 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CratP47934 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CratP47934 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CratP47934 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CratP47934 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CratP47934 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CratP47934 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CratP47934 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CratP47934 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CratP47934 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CratP47934 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CratP47934 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CratP47934 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CratP47934 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CratP47934 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CratP47934 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CratP47934 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CratP47934 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CratP47934 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CratP47934 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CratP47934 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CratP47934 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CratP47934 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CratP47934 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CratP47934 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CratP47934 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CratP47934 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CratP47934 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CratP47934 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CratP47934 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CratP47934 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CratP47934 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CratP47934 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CratP47934 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CratP47934 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CratP47934 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CratP47934 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CratP47934 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CratP47934 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CratP47934 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CratP47934 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CratP47934 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms