Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Igfbp4P47879 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Igfbp4P47879 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Igfbp4P47879 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Igfbp4P47879 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Igfbp4P47879 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Igfbp4P47879 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Igfbp4P47879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp4P47879 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms