Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Timp3P39876 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timp3P39876 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timp3P39876 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms