Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 YCR041WYCR041W 333 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YDL177CYDL177C 513 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 CUP2YGL166W 678 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YSC83YHR017W 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YRB2YIL063C 984 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YMR034CYMR034C 1305 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP11P36026 TDH2YJR009C 999 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YMR122CYMR122C 375 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP11P36026 AMN1YBR158W 1650 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP11P36026 PAC2YER007W 1557 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YER137CYER137C 447 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 DID2YKR035W-A 615 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YAR064WYAR064W 300 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 IDP3YNL009W 1263 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 ATG22YCL038C 1587 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YCR061WYCR061W 1896 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP11P36026 MPC2YHR162W 390 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YLR112WYLR112W 420 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP11P36026 CCT8YJL008C 1707 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP11P36026 UIP5YKR044W 1332 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP11P36026 PPM2YOL141W 2088 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP11P36026 HDA1YNL021W 2121 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YDR387CYDR387C 1668 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 CIR2YOR356W 1896 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 TFG2YGR005C 1203 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 MSP1YGR028W 1089 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 YHK8YHR048W 1545 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP11P36026 STT3YGL022W 2157 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP11P36026 VMA3YEL027W 483 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP11P36026 COG1YGL223C 1254 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP11P36026 YOR012WYOR012W 414 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP11P36026 YEN1YER041W 2280 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RGD2YFL047W 2145 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP11P36026 IRC11YOR013W 471 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP11P36026 BIM1YER016W 1035 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP11P36026 FAF1YIL019W 1041 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP11P36026 YMR295CYMR295C 594 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP11P36026 FSF1YOR271C 984 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP11P36026 ERS1YCR075C 783 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP11P36026 PPH22YDL188C 1134 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP11P36026 CTF19YPL018W 1110 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP11P36026 SGF29YCL010C 780 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP11P36026 ZWF1YNL241C 1518 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP11P36026 MTR3YGR158C 753 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP11P36026 MSO1YNR049C 633 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP11P36026 ASN2YGR124W 1719 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP11P36026 COX10YPL172C 1389 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP11P36026 YMR279CYMR279C 1623 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP11P36026 AIM2YAL049C 741 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP11P36026 DPH5YLR172C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP11P36026 BNA3YJL060W 1335 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP11P36026 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 HEM2YGL040C 1029 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 ATG36YJL185C 882 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 RFC4YOL094C 972 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP11P36026 PTC3YBL056W 1407 nt7.15□□□□□ -1.27
UBP11P36026 YOS9YDR057W 1629 nt7.15□□□□□ -1.27
UBP11P36026 EDC3YEL015W 1656 nt7.14□□□□□ -1.27
UBP11P36026 RNH201YNL072W 924 nt7.14□□□□□ -1.27
UBP11P36026 MIP1YOR330C 3765 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 NMD5YJR132W 3147 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 YPR196WYPR196W 1413 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 YHL018WYHL018W 363 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 MED6YHR058C 888 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 YJR146WYJR146W 354 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SRL2YLR082C 1179 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SLA2YNL243W 2907 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 ICL2YPR006C 1728 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP11P36026 CCT3YJL014W 1605 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 YBR241CYBR241C 1467 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 SGV1YPR161C 1974 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 ARE2YNR019W 1929 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 QRI5YLR204W 336 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 MRPL10YNL284C 969 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 HBN1YCL026C-B 582 nt7.12□□□□□ -1.27
UBP11P36026 PPS1YBR276C 2424 nt7.11□□□□□ -1.27
UBP11P36026 ARC35YNR035C 1029 nt7.11□□□□□ -1.27
UBP11P36026 DFR1YOR236W 636 nt7.11□□□□□ -1.27
UBP11P36026 RFS1YBR052C 633 nt7.11□□□□□ -1.27
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