Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc5P35689 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc5P35689 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc5P35689 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms