Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Notch4P31695 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Notch4P31695 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Notch4P31695 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Notch4P31695 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Notch4P31695 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Notch4P31695 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms