Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd2P30280 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd2P30280 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd2P30280 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd2P30280 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.3 ms