Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjc1P28229 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjc1P28229 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjc1P28229 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms