Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc6P23475 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrcc6P23475 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc6P23475 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms