Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn1P22387 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn1P22387 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn1P22387 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edn1P22387 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edn1P22387 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edn1P22387 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edn1P22387 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edn1P22387 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms