Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp4P21275 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmp4P21275 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp4P21275 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp4P21275 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp4P21275 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp4P21275 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms