Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1P13405 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rb1P13405 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1P13405 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1P13405 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1P13405 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rb1P13405 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1P13405 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms