Protein–RNA interactions for Protein: P11499

Hsp90ab1, Heat shock protein HSP 90-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsp90ab1P11499 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hsp90ab1P11499 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Hsp90ab1P11499 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hsp90ab1P11499 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hsp90ab1P11499 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms