Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb3P09026 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb3P09026 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb3P09026 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms