Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01748 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01748 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01748 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01748 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01748 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01748 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01748 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01748 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01748 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01748 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01748 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01748 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01748 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01748 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01748 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01748 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01748 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01748 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01748 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01748 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01748 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01748 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01748 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01748 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01748 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01748 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01748 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01748 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01748 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01748 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01748 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01748 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01748 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01748 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms